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1982年12月26日，小栗旬出生于东京都小平市。父亲“小栗哲家”是歌剧表演的舞台总监，母亲是古典芭蕾舞教师，而哥哥“小栗了”也是一名演员。小学六年级开始加入儿童剧团，当一名临时儿童演员。1996年，小栗旬参演首部电视剧《秀吉》，饰演石田三成的幼年时期。1998年，7月出演校园剧《麻辣教师GTO》。拍摄之后因演艺与修学两者不能兼顾，被迫于明星学园高等学校中途退学，从此开始了真正的演艺生涯。